Vykonanie apoptózy

Hoci detailný mechanizmus procesu apoptózy nie je úplne jasný, bolo zistené, že kaspáza, menovite kaspáza, hrá podstatnú úlohu v procese apoptózy. Proces bunkovej apoptózy je vlastne kaskádový amplifikačný reakčný proces ireverzibilnej a obmedzenej hydrolýzy kaspázového substrátu. Doteraz sa našlo najmenej 14 kaspáz. Molekuly kaspázy majú vysokú homológiu a podobnú štruktúru, pričom všetky sú proteázy cysteínovej rodiny. Kaspázy možno v zásade rozdeliť do dvoch kategórií podľa ich funkcií: jedna sa podieľa na spracovaní buniek, ako napríklad Pro-IL-1 a Pro- IL-1 δ, tvorba aktívneho IL-1 a IL-1 δ; Druhý typ sa podieľa na apoptóze buniek, vrátane kaspázy2,3,6,7,8,9.10. Rodina kaspáz má vo všeobecnosti tieto vlastnosti:

1) V C-koncovej homológnej oblasti je cysteínové aktivačné miesto a táto doména aktivačného miesta je QACR/QG.

2) Zvyčajne existuje vo forme zymogénu s relatívnou molekulovou hmotnosťou 29000-49000 (29-49KD). Po aktivácii sa jej vnútorné konzervatívne zvyšky kyseliny asparágovej hydrolyzujú za vzniku dvoch veľkých (P20) a malých (P10) podjednotiek a potom sa vytvorí aktívny tetramér pozostávajúci z dvoch párov. Každý heterodimér P20/P10 môže byť odvodený z rovnakej prekurzorovej molekuly alebo dvoch rôznych prekurzorových molekúl.

3) Koniec má malú alebo veľkú pôvodnú doménu.

Kaspázy zapojené do indukcie apoptózy spadajú do dvoch kategórií: iniciátory a efektory, ktoré hrajú úlohu v upstream a downstream transdukcii signálu smrti.